La chapelle Saint-Louis a été construite pour l’hôpital militaire de Saint-Mandrier. Ce dernier, fondé sous Louis XIV, fut reconstruit au début du 19ème siècle pour répondre aux besoins du moment. Le projet de l’hôpital, réalisé en 1818 par l’ingénieur maritime Raucourt de Charleville, fut repris par Honoré Bernard, qui en corrigea quelques défauts. Il décida que la chapelle se trouverait sur l’une des terrasses réalisées à flanc de colline, au milieu d’un parc de verdure qui comprenait le cimetière et un jardin botanique. Le bagne de Toulon fut chargé de fournir la main d’œuvre.